制订合理的保护对策, 需要准确了解该物种基本状态与变化趋势，而这依赖于海量监测数据做基础。尽管国内的野生动物保护工作开展已经几十年，但是，因为收集和整理数据, 往往需要耗费大量时间和精力, 仅靠科学家和人数有限的专业保护人员是远远不够的，所以针对中华秋沙鸭等鸟类的系统调查与监测工作几乎从未开展，为此从2014年开始实施，昆明市朱雀鸟类研究所（朱雀会）以该物种为对象，在北京市企业家环保基金会、国家地理学会空气与水保护基金等支持下，和在华北以南、青藏高原以东广大区域，包括黄河中下游支流、淮河及支流、长江各大支流、钱塘江、瓯江、闽江上游支流、珠江上游支流等各大水系中，组织开展四次连续的同步监测。这是国内迄今为止针对某一特定鸭类最大规模的越冬情况调查。该调查涵盖了25个省、直辖市、自治区，参与的观鸟会、社会团体、组织机构和群体共100多家，累积有2000余人次的观鸟爱好者、专业研究人员参与调查，获得了大量基础数据，识别了一批稳定的越冬地点，推动了包括湖南桃源沅水湿地公园、湖北松滋洈水湿地公园等保护地的建设及保护行动的开展。
中华秋沙鸭喜欢清澈的流水，对水域环境非常挑剔，是检测水环境质量的很好标识，它们选择的河流、水库，很多是当地水源地甚至是饮用水水源地，是当地“母亲河”的上游，是可以直接引发社会各方关注的环境热点。中华秋沙鸭的栖息地，包括越冬地、繁殖地和迁徙经停地，基本是在中国人口密度对比线（黑河-腾冲线）以东，都是中国人口密集的省份。相比一些珍稀物种栖息在人口稀少的偏远地区，跟大多数人口没有直接利害关系，中华秋沙鸭栖息的水域环境与中国 90%以上人口的用水需求息息相关。调查开展的同时，也通过宣传传播活动，扩大社会对珍稀物种及其栖息的水体环境的重视与保护。